Примерно через 30 лет после кончины прп. Иоанна Рыльского, в тревожное время борьбы Болгарии с Византией, при болгарском царе Самуиле (976 — 1014), преподобный Иоанн Рыльский явился игумену Рыльского монастыря и повелел перенести его мощи в город Средец (ныне София), куда скрылся патриарх Болгарский Дамиан (927 — 972). 18 октября святые мощи были открыты и обретены нетленными. Их перенесли в Средец и положили сначала в кафедральном соборе во имя святого апостола и евангелиста Луки, а в XII веке в новопостроенном храме во имя преподобного Иоанна Рыльского. При храме его имени был основан монастырь.
19 октября 1195 года, после освобождения Болгарии от Византийской зависимости Асеном I (1187 — 1196), царь перенес святые мощи в новую столицу — Тырново. На холме Трапезица воздвигнули храм, в котором и были положены мощи преподобного Иоанна. В Тырново честные мощи находились и после взятия его турками в 1393 году, и лишь в 1469 году, по просьбе братии Рыльского монастыря и благодаря помощи вдовы султана Мурада II Марии, дочери сербского деспота Георгия Бранковича, были возвращены в обитель преподобного Иоанна, где и почивают доныне. 30 июня 1469 года, при игумене Давиде, святые мощи были торжественно положены в новой гробнице в храме Рыльской обители. Празднование возвращения мощей было установлено 1 июля.
Великий праведник и подвижник Русской Церкви Иоанн Кронштадтский родился 19 октября 1829 года, в день памяти преподобного Иоанна Рыльского. В память своего небесного тезоименного покровителя он основал в начале XX века в Санкт-Петербурге женский монастырь, где впоследствии и был сам погребен, и где пребывают его мощи.
Почитание преподобного Иоанна в Болгарии настолько велико, что его можно сравнить только с особым почитанием преподобного Сергия Радонежского на Руси. Как преподобного Сергия называют «Игуменом всея Руси», так и преподобного Иоанна можно назвать «Игуменом всея Болгарии». Поражает сходство и их жизнеописаний, и их наследия — оба возрастили сонм подвижников-учеников, явившись столпами Церквей Болгарской и Русской. Основанные ими монастыри стали крупнейшими центрами духовного просвещения этих государств, а их нетленные мощи охраняют их столицы.
Считается покровителем города Рыльска Курской области. В его честь в городе построена церковь Ивана Рыльского и названа наиболее высокая часть береговой гряды — «Гора Ивана Рыльского», на которой стояла в древности Рыльская крепость и наиболее древняя часть города Рыльска. Сейчас на горе возведена часовня в честь преподобного Иоанна Рыльского, а в Рыльском Николаевском монастыре с 2006 года хранится частица мощей Иоанна Рыльского.
Его именем названа часовня на болгарской полярной станции Святой Климент Охридский, самая южная православная часовня на планете.
Тропарь, глас 4
Твои́х моще́й возвраще́нием /оби́тель твоя́ обогати́ся, /це́рковь же твоя, прие́мши я́, просвети́ся /и, крася́щися, ве́рных созыва́ет с весе́лием /светоно́сный твой све́тло пра́здновати день, /гряди́те, глаго́лющи, //и приими́те благода́тей дарова́ния.
Кондак, глас 2
Тве́рдым умо́м и непреста́нными моли́твами /бори́теля врага́ си́лу всегуби́тельную до конца́ побори́в, /досто́йно от Христа́ просла́вился еси́, /Иоа́нне всеблаже́нне. /Тем твои́х днесь моще́й возвраще́ния /све́тлый соверша́юще пра́здник в весе́лии, /согла́сно вопие́м ти: /ста́ду и лю́дем твои́м ты еси́ с Бо́гом, о́тче преподо́бне, //похвала́ и утвержде́ние.
Величание
Ублажа́ем тя, /преподо́бне о́тче Иоа́нне, /и чтим святу́ю па́мять твою́, /наста́вниче мона́хов //и собесе́дниче а́нгелов.
Молитва преподобному Иоанну Рыльскому
Земна́я звездо́ чуде́сная, я́же от преде́л Сре́дца гра́да возсия́вшая, и све́щниче живы́й, и́же всю зе́млю Бо́лгарскую све́том пра́вды Бо́жия осиява́яй, преди́вный в по́стницех уго́дниче Бо́жий, о́тче Иоа́нне, преподо́бных у́бо ра́дование, Це́ркве Бо́лгарския украше́ние, ве́ры Правосла́вныя кре́пкое утвержде́ние, ско́рый помо́щниче к тебе́ с ве́рою и любо́вию притека́ющим и вели́кий пред Го́сподем о всех нас предста́телю! Приими́, преблаже́нне, моле́ния на́ша и умоли́ Христа́ Бо́га на́шего, я́ко да вси, тобо́ю неви́димо охраня́еми и сою́зом бра́тския любве́ связу́еми, лю́дие слове́нстии в ми́ре пребыва́ют и благоче́стии, и да изба́вит их Госпо́дь от враг ви́димых и неви́димых, от наше́ствия иноплеме́нник, от неду́га и гла́да, от вся́кия ско́рби и вся́каго зла. Предстоя́щим же зде и моля́щимся пред честно́ю ра́кою моще́й твои́х испроси́, преподо́бне, у Го́спода на́шего Иису́са Христа́ вся, я́же ко спасе́нию проше́ния, да вси с тобо́ю непреста́нно прославля́ем всесвято́е и́мя Отца́ и Сы́на и Свята́го Ду́ха, ны́не, и при́сно, и во ве́ки веко́в. Ами́нь.
В этот день святая Церковь также празднует память:
Бессребреников Космы и Дамиана, в Риме пострадавших (284). Мч. Поти́та (II). Мчч. Константина чдтв. и с ним пострадавших; Маврикия; 25-ти Никомидийских; 2000 усеченных. Прп. Петра патри́кия, Константинопольского (854). Свв. Перепетуи, Павла и с ним пострадавших. Прпп. Льва пустынника; Петра, бывшего патрикия; Василия, основателя монастыря “Глубокие реки”. Прп. Ангели́ны, деспоти́сы Сербской (XVI). Сщмч. Аркадия Гаряева пресвитера (1918). Сщмч. Алексия Дроздова диакона (1942).


